微波消解仪的微波加热具有高效性。目前微波加热机理有两种理论：微博具有致热效应，即微波能对被照射物质产生深层加热的作用，形成均匀同时加热;微波又具有非热效应，即微博作用的选择性，不均一性的能量效应。

  微波消解仪试样的原理是：当微波通过试样时，记性分子随微波频率快速变换取向，分子的总能量增加，试样温度急剧上升。同时，试液中的带电粒子(离子、水和离子等)在狡辩的电磁场中，受电场力的作用而来回迁移运动，与临近分子撞击，使的试样温度升高。微波消解仪加热方式有三个方面的优点：1、体加热2、过热现象3、搅拌。微波加热快速、均匀、过热、不断产生新的接触面。有时还能降低反应活化能，改变反应动力学状况，使得微波消解能力家强，能消解许多传统方法难以消解的样品。正是这些优点，使微波消解仪广泛应用到工业生产上，提高反应功效。